Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNMO15061 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNMO15061 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms