Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms