Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E9PBE3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E9PBE3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E9PBE3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E9PBE3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E9PBE3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E9PBE3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E9PBE3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E9PBE3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E9PBE3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E9PBE3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E9PBE3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E9PBE3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms