Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HHLA1C9JL84 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms