Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PATL2C9JE40 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PATL2C9JE40 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms