Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SOBPA7XYQ1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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