Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A6NL46 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A6NL46 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A6NL46 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms