Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSDA5PKW4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms