Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4BQ9Y4P1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4BQ9Y4P1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATG4BQ9Y4P1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG4BQ9Y4P1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms