Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TTF2Q9UNY4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TTF2Q9UNY4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms