Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REREQ9P2R6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms