Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LRFN1Q9P244 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LRFN1Q9P244 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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