Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTLNQ9NXG0 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms