Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBRD1Q9NUN5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms