Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms