Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC6A20Q9NP91 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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