Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms