Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRRTQ9BXP5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms