Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms