Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB3IPQ96QF0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms