Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC7Q96M83 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms