Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00615Q96LM1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms