Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACSBG1Q96GR2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACSBG1Q96GR2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms