Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms