Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAMP4Q969E2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms