Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBXN4Q92575 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms