Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TOPBP1Q92547 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TOPBP1Q92547 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms