Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARID1BQ8NFD5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms