Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LMNTD2Q8IXW0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms