Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECW1Q76N89 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms