Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBC1D3CQ6IPX1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBC1D3CQ6IPX1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms