Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSMD4Q5XG99 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD4Q5XG99 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms