Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms