Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TDRD12Q587J7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TDRD12Q587J7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms