Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms