Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms