Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PUS10Q3MIT2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms