Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
KRTAP20-2Q3LI61 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms