Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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