Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms