Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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CDO1Q16878 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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CDO1Q16878 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDO1Q16878 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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