Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN3Q16667 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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