Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYPL1Q16563 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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