Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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GABRA6Q16445 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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GABRA6Q16445 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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GABRA6Q16445 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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GABRA6Q16445 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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GABRA6Q16445 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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GABRA6Q16445 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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