Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms