Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TAF1AQ15573 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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