Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EEA1Q15075 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms