Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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