Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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SEMA3AQ14563 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SEMA3AQ14563 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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SEMA3AQ14563 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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