Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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